Class EntitySrcGen


  • public class EntitySrcGen
    extends java.lang.Object
    Data items in the ENTITY_SRC_GEN category record details of the source from which the entity was obtained in cases where the source was genetically manipulated. The following are treated separately: items pertaining to the tissue from which the gene was obtained, items pertaining to the host organism for gene expression and items pertaining to the actual producing organism (plasmid).
    Author:
    Andreas Prlic
    • Constructor Detail

      • EntitySrcGen

        public EntitySrcGen()
    • Method Detail

      • getEntity_id

        public java.lang.String getEntity_id()
      • setEntity_id

        public void setEntity_id​(java.lang.String entity_id)
      • getExpression_system_id

        public java.lang.String getExpression_system_id()
      • setExpression_system_id

        public void setExpression_system_id​(java.lang.String expression_system_id)
      • getGene_src_common_name

        public java.lang.String getGene_src_common_name()
      • setGene_src_common_name

        public void setGene_src_common_name​(java.lang.String gene_src_common_name)
      • getGene_src_details

        public java.lang.String getGene_src_details()
      • setGene_src_details

        public void setGene_src_details​(java.lang.String gene_src_details)
      • getGene_src_dev_stage

        public java.lang.String getGene_src_dev_stage()
      • setGene_src_dev_stage

        public void setGene_src_dev_stage​(java.lang.String gene_src_dev_stage)
      • getGene_src_genus

        public java.lang.String getGene_src_genus()
      • setGene_src_genus

        public void setGene_src_genus​(java.lang.String gene_src_genus)
      • getGene_src_species

        public java.lang.String getGene_src_species()
      • setGene_src_species

        public void setGene_src_species​(java.lang.String gene_src_species)
      • getGene_src_strain

        public java.lang.String getGene_src_strain()
      • setGene_src_strain

        public void setGene_src_strain​(java.lang.String gene_src_strain)
      • getGene_src_tissue

        public java.lang.String getGene_src_tissue()
      • setGene_src_tissue

        public void setGene_src_tissue​(java.lang.String gene_src_tissue)
      • getGene_src_tissue_fraction

        public java.lang.String getGene_src_tissue_fraction()
      • setGene_src_tissue_fraction

        public void setGene_src_tissue_fraction​(java.lang.String gene_src_tissue_fraction)
      • getHost_org_common_name

        public java.lang.String getHost_org_common_name()
      • setHost_org_common_name

        public void setHost_org_common_name​(java.lang.String host_org_common_name)
      • getHost_org_details

        public java.lang.String getHost_org_details()
      • setHost_org_details

        public void setHost_org_details​(java.lang.String host_org_details)
      • getHost_org_genus

        public java.lang.String getHost_org_genus()
      • setHost_org_genus

        public void setHost_org_genus​(java.lang.String host_org_genus)
      • getHost_org_species

        public java.lang.String getHost_org_species()
      • setHost_org_species

        public void setHost_org_species​(java.lang.String host_org_species)
      • getHost_org_strain

        public java.lang.String getHost_org_strain()
      • setHost_org_strain

        public void setHost_org_strain​(java.lang.String host_org_strain)
      • getPdbx_src_id

        public java.lang.String getPdbx_src_id()
      • setPdbx_src_id

        public void setPdbx_src_id​(java.lang.String pdbx_src_id)
      • getPdbx_seq_type

        public java.lang.String getPdbx_seq_type()
      • setPdbx_seq_type

        public void setPdbx_seq_type​(java.lang.String pdbx_seq_type)
      • getPdbx_alt_source_flag

        public java.lang.String getPdbx_alt_source_flag()
        Returns:
        the pdbx_alt_source_flag
      • setPdbx_alt_source_flag

        public void setPdbx_alt_source_flag​(java.lang.String pdbx_alt_source_flag)
        Parameters:
        pdbx_alt_source_flag - the pdbx_alt_source_flag to set
      • getPdbx_beg_seq_num

        public java.lang.String getPdbx_beg_seq_num()
      • setPdbx_beg_seq_num

        public void setPdbx_beg_seq_num​(java.lang.String pdbx_beg_seq_num)
      • getPdbx_end_seq_num

        public java.lang.String getPdbx_end_seq_num()
      • setPdbx_end_seq_num

        public void setPdbx_end_seq_num​(java.lang.String pdbx_end_seq_num)
      • getPdbx_description

        public java.lang.String getPdbx_description()
      • setPdbx_description

        public void setPdbx_description​(java.lang.String pdbx_description)
      • getPdbx_gene_src_atcc

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_atcc()
      • setPdbx_gene_src_atcc

        public void setPdbx_gene_src_atcc​(java.lang.String pdbx_gene_src_atcc)
      • getPdbx_gene_src_cell

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_cell()
      • setPdbx_gene_src_cell

        public void setPdbx_gene_src_cell​(java.lang.String pdbx_gene_src_cell)
      • getPdbx_gene_src_cell_line

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_cell_line()
      • setPdbx_gene_src_cell_line

        public void setPdbx_gene_src_cell_line​(java.lang.String pdbx_gene_src_cell_line)
      • getPdbx_gene_src_cellular_location

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_cellular_location()
      • setPdbx_gene_src_cellular_location

        public void setPdbx_gene_src_cellular_location​(java.lang.String pdbx_gene_src_cellular_location)
      • getPdbx_gene_src_fragment

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_fragment()
      • setPdbx_gene_src_fragment

        public void setPdbx_gene_src_fragment​(java.lang.String pdbx_gene_src_fragment)
      • getPdbx_gene_src_gene

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_gene()
      • setPdbx_gene_src_gene

        public void setPdbx_gene_src_gene​(java.lang.String pdbx_gene_src_gene)
      • getPdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id()
      • setPdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id

        public void setPdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id​(java.lang.String pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id)
      • getPdbx_gene_src_organ

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_organ()
      • setPdbx_gene_src_organ

        public void setPdbx_gene_src_organ​(java.lang.String pdbx_gene_src_organ)
      • getPdbx_gene_src_organelle

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_organelle()
      • setPdbx_gene_src_organelle

        public void setPdbx_gene_src_organelle​(java.lang.String pdbx_gene_src_organelle)
      • getPdbx_gene_src_plasmid

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_plasmid()
      • setPdbx_gene_src_plasmid

        public void setPdbx_gene_src_plasmid​(java.lang.String pdbx_gene_src_plasmid)
      • getPdbx_gene_src_plasmid_name

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_plasmid_name()
      • setPdbx_gene_src_plasmid_name

        public void setPdbx_gene_src_plasmid_name​(java.lang.String pdbx_gene_src_plasmid_name)
      • getPdbx_gene_src_scientific_name

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_scientific_name()
      • setPdbx_gene_src_scientific_name

        public void setPdbx_gene_src_scientific_name​(java.lang.String pdbx_gene_src_scientific_name)
      • getPdbx_gene_src_variant

        public java.lang.String getPdbx_gene_src_variant()
      • setPdbx_gene_src_variant

        public void setPdbx_gene_src_variant​(java.lang.String pdbx_gene_src_variant)
      • getPdbx_host_org_atcc

        public java.lang.String getPdbx_host_org_atcc()
      • setPdbx_host_org_atcc

        public void setPdbx_host_org_atcc​(java.lang.String pdbx_host_org_atcc)
      • getPdbx_host_org_cell

        public java.lang.String getPdbx_host_org_cell()
      • setPdbx_host_org_cell

        public void setPdbx_host_org_cell​(java.lang.String pdbx_host_org_cell)
      • getPdbx_host_org_cell_line

        public java.lang.String getPdbx_host_org_cell_line()
      • setPdbx_host_org_cell_line

        public void setPdbx_host_org_cell_line​(java.lang.String pdbx_host_org_cell_line)
      • getPdbx_host_org_cellular_location

        public java.lang.String getPdbx_host_org_cellular_location()
      • setPdbx_host_org_cellular_location

        public void setPdbx_host_org_cellular_location​(java.lang.String pdbx_host_org_cellular_location)
      • getPdbx_host_org_culture_collection

        public java.lang.String getPdbx_host_org_culture_collection()
      • setPdbx_host_org_culture_collection

        public void setPdbx_host_org_culture_collection​(java.lang.String pdbx_host_org_culture_collection)
      • getPdbx_host_org_gene

        public java.lang.String getPdbx_host_org_gene()
      • setPdbx_host_org_gene

        public void setPdbx_host_org_gene​(java.lang.String pdbx_host_org_gene)
      • getPdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id

        public java.lang.String getPdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id()
      • setPdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id

        public void setPdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id​(java.lang.String pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id)
      • getPdbx_host_org_organ

        public java.lang.String getPdbx_host_org_organ()
      • setPdbx_host_org_organ

        public void setPdbx_host_org_organ​(java.lang.String pdbx_host_org_organ)
      • getPdbx_host_org_organelle

        public java.lang.String getPdbx_host_org_organelle()
      • setPdbx_host_org_organelle

        public void setPdbx_host_org_organelle​(java.lang.String pdbx_host_org_organelle)
      • getPdbx_host_org_scientific_name

        public java.lang.String getPdbx_host_org_scientific_name()
      • setPdbx_host_org_scientific_name

        public void setPdbx_host_org_scientific_name​(java.lang.String pdbx_host_org_scientific_name)
      • getPdbx_host_org_strain

        public java.lang.String getPdbx_host_org_strain()
      • setPdbx_host_org_strain

        public void setPdbx_host_org_strain​(java.lang.String pdbx_host_org_strain)
      • getPdbx_host_org_tissue

        public java.lang.String getPdbx_host_org_tissue()
      • setPdbx_host_org_tissue

        public void setPdbx_host_org_tissue​(java.lang.String pdbx_host_org_tissue)
      • getPdbx_host_org_tissue_fraction

        public java.lang.String getPdbx_host_org_tissue_fraction()
      • setPdbx_host_org_tissue_fraction

        public void setPdbx_host_org_tissue_fraction​(java.lang.String pdbx_host_org_tissue_fraction)
      • getPdbx_host_org_variant

        public java.lang.String getPdbx_host_org_variant()
      • setPdbx_host_org_variant

        public void setPdbx_host_org_variant​(java.lang.String pdbx_host_org_variant)
      • getPdbx_host_org_vector

        public java.lang.String getPdbx_host_org_vector()
      • setPdbx_host_org_vector

        public void setPdbx_host_org_vector​(java.lang.String pdbx_host_org_vector)
      • getPdbx_host_org_vector_type

        public java.lang.String getPdbx_host_org_vector_type()
      • setPdbx_host_org_vector_type

        public void setPdbx_host_org_vector_type​(java.lang.String pdbx_host_org_vector_type)
      • getPlasmid_details

        public java.lang.String getPlasmid_details()
      • setPlasmid_details

        public void setPlasmid_details​(java.lang.String plasmid_details)
      • getPlasmid_name

        public java.lang.String getPlasmid_name()
      • setPlasmid_name

        public void setPlasmid_name​(java.lang.String plasmid_name)
      • getStart_construct_id

        public java.lang.String getStart_construct_id()
      • setStart_construct_id

        public void setStart_construct_id​(java.lang.String start_construct_id)